Microscopia Virtual

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Dr. Steffen Härtel

+56 (2) 2978 6366
Email: shartel@med.uchile.cl

Steffen Härtel was born in Frankfurt (Ger) and studied physics at the University Johann Wolfgang von Goethe (Frankfurt, Ger), at the Universidad de Córdoba (Arg), at the Universidad Austral de Chile (Valdivia, Chile), and at the University of Bremen (Ger). He received fellowships of the DAAD and the Bremer Studienfonds. His Ph.D. thesis was honored with summa cum laude and received the Bremer Studienpreis in combination with the special award of the Bruker Daltonik GmbH. In 2000/2001, he worked as principal investigator at the TZI (Center for Technology and Informatics, Bremen, Ger), financed by the DfG. Between 2001 and 2003, he received a Feodor Lynen Fellowship by the Alexander von Humboldt Foundation (Ger) in combination with a postdoctoral fellowship of CONICET (Arg) and worked in Bruno Maggio laboratory’s at the CIQUIBIQ (Córdoba, Arg). In May of 2003, he joined the laboratory of Felipe Barros at the Centro de Estudios Cientificos (CECS, Valdivia, Chile) with a 3-year postdoctoral fellowship financed by FONDECYT (Chile). Since 2006, he is leading the Laboratory of Scientific Image Processing (SCIAN-Lab) at the Medical Faculty of the University of Chile, Santiago, Chile.

Steffen Härtel nació en Frankfurt (Ger) y estudió Física en la Universidad Johann Wolfgang von Goethe (Frankfurt, Ger), en la Universidad de Córdoba (Arg), en la Universidad Austral de Chile (Valdivia, Chile), y en la University of Bremen (Ger). Fue becario de la DAAD y la Bremer Studienfonds. Su PhD fue honrado con summa cum laude and received the Bremer Studienpreis en combinación con el premio especial de la Bruker Daltonik GmbH. En 2000/2001 trabajó como investigador principal en el TZI (Center for Technology and Informatics, Bremen, Ger) financiado por la DfG. Entre los años 2001 y 2003, recibió una beca Feodor Lynen entregada por la fundación Alexander von Humboldt en combinación con una beca de CONICET (Arg) y trabajó en el laboratorio de Bruno Maggio en el CIQUIBIQ (Córdoba, Arg). En Mayo del año 2003, se unió al laboratorio de Felipe Barrios en el Centro de Estudios Científicos (CECS, Valdivia, Chile) con un 3er año de beca posdoctoral financiado por FONDECYT (Chile). A partir del año 2006, es el leader del Laboratory of Scientific Image Processing (SCIAN-Lab) en la Facultad de Medicina de la Universidad de Chile, Santiago Chile.


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Dra. Eugenia Díaz

+56 (2) 2978 6367

Assistant Professor at the Faculty of Medicine, University of Chile, she obtained an MSc degree in Biological Sciences (1994) and a PhD degree in Biomedical Sciences (2002) at the same university. Her PhD thesis was carried out at Charing Cross and Westminster Medical School in London, were she studied motoneuronal dendritic morphology in the rat. Asociated research at the Laboratory of Experimental Ontogeny (LEO) and collaborator of the Scientific Image Analsys (SCIAN) Lab, she is currently studying the cytoarchitectural and volumetric organisation of structural asymmetries in the human brain. Her fields of expertise are morphology, histology, immunocytochemistry, 2D-3D neuronal reconstruction and volumetric analysis of brain nuclei.

Profesora Asistente de la Facultad de Medicina de la Universidad de Chile, obtuvo el grado de Magister en Ciencias Biológicas (1994) y el grado de Doctor en Ciencias Biomédicas (2002) en la misma universidad. Realizó su tesis de doctorado en Charing Cross and Westminster Medical School, Universidad de Londres, enfocando su estudio en la caracterización morfológica del árbol dendrítico de motoneuronas espinales en la rata. Es investigadora asociada del Laboratorio de Estudios Ontogénicos (LEO) y colaboradora del Laboratorio SCIAN (Scientific Image Analsys). Actualmente se encuentra estudiando la organización citoarquitectónica y aspectos volumétricos de asimetrías estructurales del cerebro humano. Tiene experiencia en morfología, histología, inmunocitoquímica y análisis volumétrico y reconstrución 2D-3D de núcleos cerebrales.


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Alejandra García MSc.

+56 (2) 2978 6266
Email: al_garcia@med.uchile.cl

Medical Technologist from the University of Chile, where she recently became an MSc student in Biological Sciences. She has worked with different fluorescence related techniques (FRET, FRAP, colocalization analysis and advanced image processing) in cellular and lipid vesicle systems (GUVs). She joined SCIAN in March 2007. She is currently involved in a biomedical research project seeking to investigate the importance of DNA fragmentation for the fertility of sperm samples, using sophisticated mathematical routines for the quantification of fluorescence signals in microscopic images.

Tecnologa Médica de la Universidad de Chile, donde ella realiza sus estudios de Máster en Ciencias Biológicas. Ella ha trabajado con diferentes técnicas de fluorescencia (FRET, FRAP, análisis de colocalizacion y procesamiento avanzado de imágenes) en sistemas celulares y sistema de vesícula lipídica (GUVs). A partir de Marzo 2007 se integro al laboratorio SCIAN. Actualmente trabaja en un proyecto de investigación biomédica, cuyo objetivo es investigar la importancia de la fragmentación DNA para la fertilidad de muestras de esperma, usando rutinas matemáticas avanzadas para la cuantificación de las señales de fluorescencia en las imágenes de microscopio.


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Maurizio Mattoli

+56 (2) 2570 9683
Email: mmattoli@ingmattoli.com

Expert on telemedicine software and services. Mattoli Ingeniería Ltd. (e-Health) Managing Partner.

Experto en servicios y aplicaciones software en ámbito telemedico. Managing Partner de Mattoli Ingeniería Ltda. (e-Salud).


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Paula Segura, MD, MSc.

+56 (2) 2978 8641
Email: psegura@med.uchile.cl

Medical Doctor and anatomic pathologist, University of Chile, with specialized training in Renal Pathology at Brigham and Women’s Hospital, Harvard Medical School, Boston, USA. She obtained the degree of master in healthcare administration and management at University of los Andes with a thesis on clinical applications of an innovative healthcare business model. Currently working at Clinical Hospital of the University of Chile in the areas of gynecological cytology, surgical and kidney pathology. Her fields of expertise are diagnostic applications of morphology, histology, cytology, immunofluorescence, and electron microscopy. At this time is developing research on pathogenic mechanisms of lupus nephritis, epidemiology of glomerulopathies and cervical cancer.

Médico Cirujano y Anátomo Patólogo, Universidad de Chile, con entrenamiento especializado en Patología Renal en el Brigham and Women’s Hospital, Harvard Medical School, Boston, USA. Obtuvo el grado de Magíster en Administración y Gestión en Salud en la Universidad de los Andes con una tesis sobre la aplicación clínica de un modelo innovador de negocios en salud. Actualmente trabajando en el Hospital Clinico de la Universidad de Chile en las áreas de patología general, citología ginecológica y nefropatología. Tiene experiencia en aplicaciones diagnósticas de morfología, histología, inmunofluorescencia, citología y microscopía electrónica. En este momento realiza investigación en mecanismos patogénicos de nefropatía lúpica, epidemiología de glomerulopatías y del cáncer cervicouterino.


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Gonzalo Rojas

Email: grojasalcayaga@yahoo.es

Oral Surgeon of University of Chile. Master in Bucomaxilofacial Pathology University of Chile. Diplom in Diagnostics Test, Pontificia Universidad Católica de Chile. Diplom in Oral Medicine, Academia Iberoamericana de Patología Oral, España. Associated Professor Odontology Faculty of University of Chile and Director of Oral Patology Department. Chief in Anatomy Patology Service of the Faculty of Odontology in University of Chile. Actually, researcher in Fondecyt Proyect “Role of HPV-16 E6 and E7 oncoproteins in tobacco-smokeassociated carcinogenesis: Interaction between cigarette smokecomponents (CSC) andHPV16 E6/E7 oncoproteins in oral and bronchial epithelial cells and clinical specimens”.

Cirujano Dentista de la Universidad de Chile. Master in Patología Bucomaxilofacial de la Universidad de Chile. Diplomado en Pruebas Diagnósticas, Pontificia Universidad Católica de Chile. Diplomado en Medicina Oral, , Academia Iberoamericana de Patología Oral, España. Profesor Asociado dentro de la Facultad de Odontología de la Universidad de Chile y Director del Departamento de Patología Oral. Director del Servicio de Anatomía Patológica de la Facultad de Odontología de la Universidad de Chile. Actualmente es investigador del Proyecto Fondecyt “Role of HPV-16 E6 and E7 oncoproteins in tobacco-smokeassociated carcinogenesis: Interaction between cigarette smokecomponents (CSC) andHPV16 E6/E7 oncoproteins in oral and bronchial epithelial cells and clinical specimens”.


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Jimena López

+56 (2) 2978 9642
Email: jime.lopc@gmail.com

Biomedical Engineer, Universidad Privada del Valle, Cochabamba, Bolivia. She was Born on Cochabamba, Bolivia. Business Practice at bioengineering service Hospital Obrero No2 Caja Nacional de Salud Cochabamba , personal technical support at maintenance department of medical device in the company Leonis Home Medic, personal technical services, medical device management, installation, applications, projects of medical equipment and laboratory, company Intersanitas S.R.L. (La Paz – Bolivia), Biomedical Engineer at Centro de Salud Tiraque – Cochabamba. Currently pursuing the master’s program in medical informatics at the University of Chile, and is working part-time on the project of Digital microscopy as support staff software evaluation for quantification of digital images. Futhermore is the coordinator for scanning times.

Ingeneniera Biomédico, Universidad Privada del Valle, Cochabamba, Bolivia. Nacida en Cochabamba, Bolivia. Realiza su práctica de negocios en el Servicio de Bioingeniería del Hospital Obrero N°2 de la Caja Nacional de Salud de Cochabamba, realiza actividades de soporte tecnico en el Departamento de Mantención de Equipos Médicos para la compañía Leonis Home Medic, servicios técnicos personales, gestión de dispositivos médicos, instalación, uso, proyectos de equipamiento médico y laboratorio, en compañía Inersanitas S.R.L (La Paz – Bolivia). Ingeniero Biomédico en el Centro de Salud Tiraque – Cochabamba. Actualmente realiza el Master de Informática Médica de la Universidad de Chile, además trabaja en forma part-time en actividades para para el Proyecto de Microscopía Digital como parte del equipo de apoyo para la evaluación de Software de cuantificación de imágenes digitales. Además es coordinadora de horario de escaneo de imágenes


Foto de Stefan Sigle
Stefan Sigle

+56 (2) 2978 9642
Email: siglestefan@gmail.com

Graduated 2015 in Medical Informatics (MSc.) from the Ruprecht-Karls-Universität Heidelberg and Hochschule Heilbronn. His thesis dealt with the challenge of developing and implementing an architectural concept of Virtual microscopy. One of the main focus during the development process was the proximity to the user to familiarize and resolve mental reservations towards the new technology using state of the art user based requirement engineering processes. The focus now lies within implementing the service maximizing the utilization for the involved institutions providing automated quantification of digital images as well as providing world wide access to these images.

Graduado el 2015 de MSc. Informática Médica en la Universidad de Heidelberg y la Universidad de Heilbronn. Su tésis trata acerca del desafío de desarrollar e implementar el concepto de la arquitectura de la Microscopía Virtual. Uno de de sus principales objetivos durante el desarrollo del proceso del trabajo fue el contacto y la proximidad con los usuarios para familiarizar y resolver aspectos clásicos dentro de la anatomía patológica frente al uso de la nueva tecnología, basados en requerimientos de la ingeniería de procesos. Hoy en día su objetivo es contribuir a implementar el servicio de la cuantificación automática de imágenes digitales para las instituciones involucradas como además contribuir al acceso a través de la web de éstas imágenes.


Foto de Raquel Pezoa
Raquel Pezoa

+56 (2) 2978 6266
Email: raquel.pezoa@usm.cl

Ph.D student in Computer Science at Universidad Técnica Federico Santa María (UTFSM), Valparaíso. In 2008, I obtained the Computer Engineering degree and Master in Computer Science, both from UTFSM. I have experience in the analysis of immunohistochemistry stained tissue images (IHC-images), working with Support Vector Machines for the classification of the structures of the IHC-images. Currently, I am interested in the automatic segmentation of cells having missing information (subjective contours or surfaces) and in the use machine learning techniques for cellular structures identification.

Alumna del Doctorado en Ciencias Computacionales de la Universidad Técnnica Federico Santa María (UTFSM), Valparaíso. En el año 2008, obtuvo su grado de Ingeniería Informática y el Magister en Ciencias Informáticas, ambos en la UTFSM. Posee experiencia en análisis de imágenes de tinciones de tejidos (imágenes de IHC), trabajando con Máquinas de Soporte Vectorial para la clasificación de estructuras de imágenes de IHC. Actualmente, está interesada en la segmentación automática de células que han perdido información (contornos subjetivos o superficies) y en el uso de técnicas de máquinas que aprenden para identificación de estructuras celulares.


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Sebastián Fernández

+56 (2) 2978 9642
Email: sebastian.fernandez.frez@gmail.com

Biomedical Engineer, from Universidad de Valparaíso (2010). His pregrade thesis was studying and evaluating the RIS-PACS system impact inside a privat health institution. Has made consultancies in companies related with health devices services and provision. Also, has given consultancy in public health sector projects, related with the construction of hospitals, planning, analyzing and designing of installed capacity of medical devices and IT systems . Actually is student inside the Master in Medical Informatics in the University of Chile, developing and implementing a traceability system for the received slides inside the CPDAI center. The above with the information taked from virtual microscopy process inside danish hospitals and the work done inside of anatomy pathology services in Chile.

Ingeniero Civil Biomédico de la Universidad de Valparaíso (2010). Su tesis de pregrado la realizó estudiando la evaluación del impacto de un Sistema RIS-PACS en una institución de salud privada. Ha realizado asesorías a empresas ligadas a los servicios y provisión de dispositivos médicos. Además ha prestado asesorías en proyectos de construcción hospitalaria para el sector público de la salud en Chile en asuntos relacionados a la capacidad instalada en etapas de planificación y diseño, tanto para dispositivos médicos como sistemas informáticos. Actualmente realiza su tesis de Magíster en Informática Médica dentro de la Universidad de Chile, desarrollando e implementando un sistema de trazabilidad para las muestras recibidas por el servicio de digitalización de CPDAI. Lo anterior a partir de experiencias recogidas de procesos de microscopia virtual en hospitales daneses y del trabajo que se realiza en los servicios de anatomía patológica dentro de Chile.